我不合适 и 我不适合 - какая разница?

говоря об одежде, употребляю 我不合适。меня поправляют 我不适合。принципиальна ли разница?

да.

这件衣服不适合我。
适合 动词 带宾语
合适 形容词 不带宾语

ок. вот для меня "не подходит" - понятие растяжимое. может не нравиться фасон, цвет, крой. а как сказать "не подходит по размеру"? 这件衣服的大小不适合我？нормально?

2017.02.20тгпу 这件衣服的大小不适合我？нормально?

да, норм, я еще в конец 的 поставил бы, но это опционально.
по словоупотреблению - купите пару учебных словарей (подчеркиваю - учебных, не переводных и не толковых), там много примеров использования, сочетаемость и проч.
а так запоминайте такие случаи.
Например, 互相 не то же самое, что 相互.

Правильнее:
这件衣服的大小适合我吗？

предложение утвердительное, вопрос по невнимательности поставил.